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河海大学研究生院（官网：gs.hhu.edu.cn）是国家最早设立的56所研究生院之一，是国家高层次人才培养和科技创新的重要基地，河海大学研究生院坐落在南京市区风景优美的清凉山麓，在水利学科研究生培养方面具有广泛的社会影响，是我国最大的水利学科研究生培养基地。

河海大学研究生教育始于50年代，是国家首批招收博、硕士生的单位和全国最早开展研究生教育的学校之一。河海大学研究生院具有良好的研究条件，紧密依托学校各类研究院（所）、工程中心、实验室培养高质量研究生。2007年以来，学校已有240余项国家及省部级科研成果获奖，其中一批科研成果在理论上有重大突破，达到国际领先和国际先进水平。

河海大学共有20个院系可招收研究生，在校研究生14750人。河海大学研究生院坚持把提高研究生培养质量作为各项工作的重中之重。发起建设的长江黄河研究生培养基地、西部研究生培养基地被批准为国家研究生创新中心。全面启动和实施研究生教育创新工程，大力开展研究生科技文化艺术活动，全面提高研究生的综合素质、创新精神、创新能力。

河海大学研究生院积极推进国际合作与交流。目前已为亚洲、非洲、美洲、欧洲40多个国家和地区培养了近千名学生。已经与这些国家和地区的50余所大学和科研机构建立了稳定的校（所）际协作关系。隶属联合国教科文组织的国际水文水资源培训与研究中心设在我校，同时设有环境、岩土、力学研究中心等国际合作科研基地。